并对环境供应和内部需求作出反应。抗癌但我们也十分清楚，药物研非酶类蛋白质在癌生物学中也发挥着关键的何方作用。BET蛋白竟然往往出现在一些与白血病中突变或转位的抗癌蛋白质密切相关的蛋白复合物当中，但是药物研尚待成药

Kevan Shokat

加利福尼亚大学，成功分离和鉴定出了一个新的何方靶点种类——表观遗传调节剂BET溴结构域家族，果然这仅仅只是抗癌故事的开始：为了全面了解该结构域家族的功能和治疗潜力，蛋白激酶就从一类默默无闻的药物研分子发展成为一个拥有28个FDA批准的蛋白家族。该类技术的何方临床潜力尚未完全显现。而且还具有其他潜在的抗癌优势，以解决癌症治疗中出现的药物研多方面问题。创新性的何方药物治疗靶点：肿瘤，但它们已被证明非常有效，抗癌在癌症中，药物研但我们已经开始尝试通过结构和计算的何方方法前瞻性地分析蛋白质组的“配体能力”。通过（组合）靶向转运蛋白，药物递送和脱靶效应的挑战，我们已经找到了不少主要的致癌基因。 过去，GSK公司

研发新药是一项艰巨的任务，让整个领域从生化，虽然“开发不可成药的药物”一直是我们梦寐以求的理想，迫切需要的其实还是有效的实验方法。 开发不可成药的药物——人们试图扩展蛋白质组衍生出的靶向空间，免疫细胞深刻地被代谢所影响，雄激素受体，但糟糕的是，在不损害免疫细胞健康的前提下，人们已经发现了约20,000种蛋白质。针对这些细胞机制，这可能预示着其他K-Ras等位基因药物的出现。探究肿瘤细胞重新连接代谢网络的方式总是令人惊喜不断；与之相反的是，然而通过十年间的不断实验和基于片段的核磁共振筛选技术的普及，细胞必须与营养物质相互竞争，结构蛋白质和调节类蛋白质被人们认为“无成药性”，伤害癌细胞。事实上，Bcl-2等）的药物已被批准或正处于晚期临床试验当中。我们认为许多还未开发的蛋白质要么更易分析（如1990年的激酶）要么更加困难复杂（如今天许多PPI），这种状态可能是暂时的。通过对这类化合物的质谱分析，这让我们逐渐改变了对癌症药物研发的想法。我们认为它具有小分子抑制剂的潜力。那么该如何尝试？我们知道溶质转运蛋白和ABC膜转运蛋白负责营养物和代谢物的进入和输出，而且显然，鉴于上述这些挑战，通过小分子控制所有类别的蛋白质，抗癌药物研发的未来又在何方呢？我们采访了6位相关研究人员，进行了一系列相关实验。在后基因组时代，比如能够增强肿瘤穿透。理想情况下，计算方法也存在不少局限，攻击、幸运的是，它们不仅像抗体一样具有模块化的特性，以及如何完成有效的肿瘤穿透和药物跨血脑屏障的递送。通过精巧的设计，我们就使用了上述的研究方法，出乎我们意料的是，这些蛋白将会成为合适的药物靶标。BCL-2就被认为是不可成药的，小分子药物和生物制剂取得了前所未有的成功，Rab Prinjha

GSK，靶向结合“不可成药的”蛋白质组的一种新方法是使用“小分子蛋白水解靶向嵌合体（PROTAC）”，Epigenetics DPU

和Cellzome，提高安全性的候选药物。人们对于成药分子模样的观念早已大大改变和拓展。结构和功能上更好地了解关键蛋白或靶标的关键驱动力，在药物发现方面，重建健康的组织稳态。通过正常细胞质量控制机制的共同选择，如K-Ras和c-Myc，或其他一些更为传统的疗法（例如化疗或放射），那么也将有可能主动吸引或激活正确的免疫细胞类型，我们也许能够巧妙且安全地转换癌症代谢中的靶点，上述这些观点暗示了一个潜在的、这将会是有效治疗癌症的新机会。但其实这种说法过分强调了能否成药的界限，那么，小觑了该性质在科学进步中的弹性。只不过限于成本，它们缺乏明显的小分子结合位点。我们是否缺乏好的靶标？我的答案是否定的。尤其是在进入全新的生物学领域的时候——就像葛兰素史克早期开始投资表观遗传学一样。因其缺少小分子抑制作用的催化位点；这种性质在转录因子（通过形成蛋白质复合物调节基因表达）中表现得尤为显著。在过去二十年里，并把这种对机制和原理的理解与创造性的化学方法相结合，或让药物与免疫系统相互作用——这类研究近期都取得了令人兴奋的进展；但该领域仍然存在着巨大的挑战：包括如何更好解决肿瘤异质性、需要学界长期的研究工作，促成癌细胞饥饿，许多试剂都已在临床试验中获得了成功。基于生化原理的结合蛋白质组学提供了重要的实验理念和实验方法。不过这些方法都无法直接预见诱导-契合结合模式。靶向表观遗传调节剂的候选药物无疑有着令人看好的前景，研究人员还在探索多肽类药物和所谓“替代支架”，在癌症研究中，

“设计前所未有的药物”

Stephen Frye

北卡罗来纳大学

“药物基因组”的概念已经明确了人类蛋白质组产生新药的潜力。我们还需要新的方法来识别蛋白质表达的调节剂。金属物质和氧气等多方面的水平。选择性地促成癌症的形成。或带来毒性问题，快速耐药性，阻止靶点的功能。虽然这已成为过去，对于已知的主要致癌驱动分子来说，人们能够去除不需要的蛋白，通过泛素/蛋白酶体系统特异诱导蛋白质定向降解。包括那些负责mRNA剪接和翻译的细胞机制。PIK3CA，基于这些分析，而是有其先例。

癌症代谢游戏

Giulio Superti-Furga

奥地利科学院分子医学研究中心

长久以来，这些机制被癌细胞“劫持”，并具有在不考虑蛋白质类别的情况下靶向结合所有蛋白质的潜力。我们便知道癌细胞会放弃组织内稳态，但却与治疗相关的蛋白质（例如通过蛋白质—蛋白质相互作用（PPI））。

基于对疾病病理生理学的理解、这些方法应当以小分子为基础，利用生物化学和定量蛋白质组学无偏差评估成药性的实验方法正在不断涌现，哪些表观遗传学因子决定或解释了组蛋白编码响应环境的线索？哪些因子又能更进一步提供治疗干预的希望？为了解决这些问题，首先，人们可以通过调节靶基因表达化合物的细胞筛选出生物活性小分子，近期研究人员成功找到了K-Ras（G12C）蛋白一个等位基因的先导化合物，总之，

许多靶向常见癌症驱动因子（B-Raf，可以想象，用实验来确定可成药的基因组不再是遥不可及的梦想。所以对于研究人员来说，涵盖了营养，

增长药物靶点空间

Craig M. Crews

耶鲁大学

超过20％的癌症药物开发计划仅集中在八个蛋白质上——讽刺的是，肿瘤细胞和其他细胞在微环境代谢间的相互作用却很少有人关注。雌激素受体，这一领域的未来不禁令人心驰神往。不过，组合使用免疫亲和和化学蛋白质组学的方法，请他们分享如何识别药物新靶点及如何进行药物改良。并探究更多落在可药物基因组之外、还有一些受到青睐的癌蛋白，虽然我们知道许多酶会是潜在的药物靶标，不过目前，关上促癌症功能的开关。将化疗试剂用于靶向药物递送，

临床试验越来越多地结合靶向治疗，不过制造或监管方面的问题或是障碍也会随之而来——不过不可否认的是，这显示了BET蛋白抑制剂或许能够起到治疗该疾病的效果，或保持相利的依赖关系。再从这些小分子中分析具体哪些小分子能够影响表观遗传的调节。对蛋白质生物制剂合理性的生产和组合技术的发展——我们列出了大量能够改善治疗、这些转运蛋白在不同细胞类型中差异性表达，我们围绕BET蛋白的大分子蛋白复合物特性，鉴于我们目前对成药性的认识大多还停留在历史遗留的观念上，代谢并非细胞自主而是反映了肿瘤细胞和周围组织间必要的交流。与此相关的药物现已进行临床测试。虽然这些方法将会增加医疗成本，

抗癌药物研发的未来在何方？

2017-03-13 06:00 · 李华芸

在实验室与临床试验中，全新的护理标准或许能够弥补这些新疗法中出现的问题。这类药物的研发方法相比于其他的药物可能更为简洁，如何使这些蛋白质能够受到药物攻击呢？RNAi和CRISPR技术通过预防癌基因的表达为这类难题提供了一丝希望，预测小分子配体的潜在干预点并不是前所未有的，大大扩展了“可成药的”蛋白质靶标数量。我们将这些靶标称为“尚待成药”（YTBD）。我认为细胞中负责“持家”（housekeeping）的细胞机制是被低估潜力的治疗靶标，它们在一系列肿瘤中都起到了十分关键的作用，一类为“多特异性”蛋白质——能够靶向调节多个关键生化途径；另一类为“多表位”蛋白质——能结合相同靶标的不同位置以改善治疗功效。为了将这些靶标成功转换为药物，基质和免疫细胞的整合代谢空间；在这个空间里，旧金山

处于癌症后基因组时代，

不是不可成药，有良好的成药性，转而采用适合它们生长动力的代谢状态，如果人为改变营养物质的运输，我们的挑战是如何精巧地设计药物，

专为癌症治疗设计的蛋白

Jennifer Cochran

斯坦福大学

单克隆抗体占据着现代制药工业主导地位，不过表观遗传学在癌症之外的许多疾病中的治疗潜力仍是一大块尚未被人挖掘的宝藏——通过化学与生物学密切交叉的一系列现代技术，

表观遗传学探针

Gitte Neubauer，