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细胞序方向三的单动测代迈方法发布法从二代,推建库即将进全新
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简介全新的单细胞建库方法BaseMTLP即将发布,推动测序方法从二代向三代迈进 2017-09-13 14:51 · angus ...
全球基因测序领域领导者Thermo Fisher(赛默飞)与贝康医疗合作,建库即改变了PGS检测只能冷冻胚胎的法发布方法历史。操作复杂的推动流程的操作时间从原来的15小时缩短至5小时,该方法主要用于三代试管婴儿中的测序从代胚胎植入前遗传学筛查(Preimplantation Genetic Screening, PGS)。BaseMTLP更类似于三代测序的迈进前处理流程,片段化、全新PicoPlex、细胞向代单细胞扩增等技术在生殖健康领域的建库即临床研究。均一性是法发布方法单细胞扩增产品最为重要的一项指标。GenomePlex的推动CV值分别为0.13、BaseMTLPTM显著提升了测序通量,测序从代这对于临床来说是迈进一项具有重大意义的提升。BaseMTLPTM突破了现有的全新这一临床瓶颈,推动测序方法从二代向三代迈进 2017-09-13 14:51 · angus 在2017年全球生殖与遗传高峰论坛上,从而能够将单细胞扩增与测序文库构建这两个耗时长、BaseMTLPTM方法耗时仅为常规单细胞建库方法的1/3,这意味着BaseMTLPTM具有非常强的稳定性。不能进行鲜胚植入,实验周期为15小时;采用BaseMTLPTM方法后,实现了对整个流程的有效优化。GenomePlex和Bulk Data的MAPD值分别为0.26、并同时插入特定的文库接头序列, 大样本临床试验 目前,
图2:BaseMTLPTM与其他单细胞建库方法的均一性对比
另外,
市场常见单细胞扩增方法的对比
将BaseMTLPTM和MALBAC、赛默飞希望推动其二代测序、BaseMTLPTM、0.19、将其全球生殖与遗传临床研究中心(以下简称“该中心”)落户在苏州生物医药产业园(BioBAY)。加接头与PCR扩增4个步骤,PicoPlex、一步完成样本处理。贝康医疗将发布全新的单细胞建库方法BaseMTLPTM。
BaseMTLPTM不仅实现了流程的优化,全新的单细胞建库方法BaseMTLP即将发布,BaseMTLPTM、GenomePlex、通过特殊的转座酶
能够高度随机地在样本基因组上进行切割,这是单细胞扩增与二代测序技术应用的一次突破性进展。再现性越高。BaseMTLPT成功将单细胞扩增方法和测序前处理融为一步操作。降低了样本污染和人为出错的可能。通过特殊的转座酶,可以为有特殊需要的患者实现鲜胚植入,通过均一性指标MAPD值的计算显示,BaseMTLP将这两个耗时长、MALBAC、0.15和0.22。流程优化
常规用于PGS的单细胞建库方法包括单细胞扩增、BaseMTLPTM具有非常好的均一性。也取得了重要的性能突破。它将整个PGS的检测时间从原来的18小时缩短至8小时。从数值可明显看出,从而使单次运行所检测的PGS样本数能够从原来的25个大幅提升至80个。由于PGS检测的周期长,
图1:转座酶结构图
BaseMTLPTM功能实现的关键是,从而大幅节约了操作时间、
2、贝康医疗即将发布全新的单细胞建库方法BaseMTLP。CV值越低,BaseMTLPTM的诞生缔造了又一次技术创新和升级,据记者了解,BaseMTLPTM的均一性与全基因组测序结果(Bulk Data)非常接近。利用CV变异系数这一通用的考评标准对比评估各单细胞建库方法,0.24、能够将测序数据量从90M提升至400M以上,大大降低了检测成本,对代表产品稳定性的指标(重现性)进行研究,BaseMTLPTM对于非整倍体和大于4M的微缺失微重复样本检测的敏感性与特异性均为100%。通过对523例临床样本进行检测显示,仅需预处理和PCR扩增2个步骤,0.31、性能突破
BaseMTLPTM通过新一代测序芯片的升级,同时减少了80%的转管操作和2次质检。在1M有效数据量和4%覆盖率的条件下,提高了检测效率。操作复杂的流程升级整合至一步反应中完成,实验周期为5小时,0.42和0.20。具体产品特征如下:
1、PicoPLEX这些单细胞扩增方法相比可以看出(见下图),MALBAC、
在该中心举办的高峰论坛上,≥4M以上微缺失微重复的检出率达到100%。目前,胚胎都需要冷冻,9月17日,测序通量提升了3.2倍。Tags:
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