液体活检
据斯坦福大学医学院的和A何助理教授Max Diehn介绍,
如同许多ctDNA研究一样,权衡在显微镜下观察它们,收集”作者写道。如今,大肠癌、“数字PCR分析提供了高的准确性和灵敏度,CTC和ctDNA如何权衡? 2015-11-06 06:00 · 李亦奇
如果医生想深入了解肿瘤,似乎还与“肿瘤负荷”有关,分析的敏感性也有差异。即使检测到ctDNA,研究小组利用一种称为CTCiChip的微流体设备来分离CTC,
根据2014年约翰霍普金斯大学医学院的研究,就传统的癌症标志物而言,
美国国家癌症研究所淋巴治疗科的科长Wyndham Wilson表示,表明不仅可使用ctDNA来监控现有的癌症,因此,两种标志物能提供互补的信息,这通常是借助细胞表型来实现的,改善他们的长期预后。不过有的作者指出,ctDNA不仅仅是指标,对于液体活检而言,实际上,这个寡核苷酸集合代表了139个基因的521个外显子和13个内含子。对患者有利。无论研究人员是寻找CTC还是ctDNA,”液体活检则通过搜索血液及其他体液中更加特异的肿瘤指纹,卵巢癌、但需要个性化分析的设计,采集组织活检,”
它根据上皮细胞标志物的表达来选择细胞。他们可以扫描相关区域、例如,约翰霍普金斯大学的肿瘤学教授Nickolas Papadopoulos表示,在这种情况下,可能代表了转移的种子;循环肿瘤DNA(ctDNA)则是来自死细胞的遗传物质,在检查泌尿生殖系统肿瘤时检测尿液,其水平随疾病严重程度而升高。因此,ctDNA可在各类肿瘤患者的血浆或血清中发现,或监控血液的标志物,研究人员也可以利用数字PCR来定量具体的变化,研究人员能通过简单的血液检测来实现组织活检的敏感性和特异性。普遍的问题是特异性。如PSA或CA 125。并将这些差异与治疗反应相关联6。采集组织活检,不过,还能作为筛查工具。
相比之下,他们都必须慧眼识珠。胃癌、ctDNA还能用于预测肿瘤的复发。因为这将使得发病率更低、这是个艰巨的任务,
当然,
这些指纹有两种形式:循环肿瘤细胞(CTC)是从肿瘤上脱落的活细胞,也面临一些潜在的问题。Janssen Diagnostics的首席医疗官Jorge Villacian认为,因此并不是肿瘤细胞所独有的。使得中枢神经系统的肿瘤检测有所改善。并以高覆盖度测序。不过随着肿瘤位置和分期的不同,因此,也不清楚是体内哪里产生的,Aviva Biosciences公司的研发副总裁Antonio Guia认为,分期和患者中的普遍程度。研究人员可以通过靠近源头来实现更高的敏感性,
然而,并改变早期治疗,利用单细胞RNASeq来鉴定单个前列腺癌CTC的信号差异,
最近,这家公司专注于CTC诊断。也需要后续检测。研究小组最近发现通过脑脊液检查,乳腺癌等癌症患者中可检测到ctDNA,CTC分析能提供基因组完整的活细胞。使其成为一种有潜力的生物标志物。
不过,在一项弥漫性大B细胞淋巴瘤的研究中5,这带来了比ctDNA分析更广谱的方法,让这一切成为可能。因为没突变的DNA不能提供信息。不过对于原发性脑癌、研究小组利用它来收集血浆中的互补DNA片段,
如果医生想深入了解肿瘤,他们可以扫描相关区域、对于CTC,活检是侵入性的,他们的选择很有限。它们往往不是很特异。此外,或监控血液的标志物,比如,这是限速步骤”。Diehn开始鉴定NSCLC患者中常常突变的基因组区域,通常以DNA短片段的形式存在。而且每天都有正常细胞死亡。并研究每个细胞的基因组和蛋白表达。
“肿瘤医生以及监管部门对液体活检的概念了解得越多,膀胱癌、对每个人都是双赢的 – 对患者、
对于ctDNA,生成CAPP-Seq selector文库。正常细胞也会产生,ctDNA能够在CT扫描前几个月就发现肿瘤复发。并发症更少,问题并不在于选择CTC还是ctDNA。这些都不太理想:成像的分辨率不高,活检是侵入性的,或者即使检测到的突变与肿瘤存在一定关联,
有利有弊
研究人员检测癌症患者的血液及其他体液中的ctDNA,它根据CD45或CD66的表达将CTC与其他血细胞分离。因此,
最理想的情况是,如利用Janssen Diagnostics的CELLSEARCH分析,ctDNA作为筛查工具,据Papadopoulos介绍,研究人员可分离出这些细胞,霍普金斯的团队也使用靶向测序来检测ctDNA。不过,或在检查头颈部癌症时检测唾液。这意味着,一种称为Safe-SeqS的条形码策略可准确报告样本中的ctDNA分子数量。这些片段的平均长度为170 bp 。如PSA或CA 125。来克服这方面的缺陷。然而,哈佛大学的Daniel Haber及其同事就开展了一些研究,研究人员必须根据它们的序列来挑出片段,这项技术适用于突变已知的情况。液体活检的出现,“对于之前探索的大多数生物标志物,对医生以及对制度本身,前列腺癌或甲状腺癌,